16日至17日早晨，广东大部、香港、澳门、海南岛北部、广西东南部及湖南南部、福建东北部、台湾岛东部、浙江北部和东部、江苏南部、安徽东南部出现暴雨或大暴雨，广东深圳、惠州、江门、云浮、茂名和香港、广西玉林、海南临高、江苏苏州、台湾屏东等部分地区特大暴雨（250—362毫米）；广东中西部、广西东南部最大小时降雨量30—60毫米、局地70—95毫米。

16日白天至夜间，广东中南部和沿海大部、广西中东部、福建东部和南部最大阵风有8—11级，广东珠江口和中部沿海地区、香港、澳门、广西玉林等地的部分地区有12—13级，江门、中山、珠海、深圳、惠州、汕尾、香港、澳门等局地14—17级，最大惠州沱泞列岛62.8米/秒（17级以上）；广东中部沿海地区及香港、澳门等地10级以上大风持续时间有10—16小时，深圳、珠海局地达18—20小时。

另外，16日下午至夜间，广东惠州到阳江一带沿海地区出现1—1.8米的风暴增水，珠江口附近增水达2—3.4米。

截至9月17日11时统计，受台风“山竹”影响，广东、广西、海南3省（自治区）29市129个县（市、区）141.9万人紧急避险转移和安置，4人因灾死亡。具体灾情仍在进一步核查统计中。

其中，广东广州、深圳、江门等17市81个县（市、区）105.3万人紧急避险转移和安置，4人因灾死亡（其中，3人因树木倒压所致，1人因构筑物倒塌所致）。

广西北海、玉林、钦州等9市36个县（市、区）26.4万人紧急避险转移和安置；100余间房屋不同程度损坏；农作物受灾面积2.5千公顷；直接经济损失近1300万元。

海南海口、三亚、儋州3市2个县（区）及琼海、文昌、万宁等10个县（市）10.2万人紧急避险转移和安置。